近日，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所牛遺傳育種科技創新團隊通過整合多組學信息，研發出基因組預測新方法，顯著提升了肉牛重要經濟性狀的預測準確性，為揭示復雜性狀遺傳基礎和優化基因組選擇策略提供了新思路。相關研究成果發表在《生物學指南（Biology Direct）》上。
國內外研究表明，利用轉錄組、表觀組等多組學信息可有效鑒定與表型相關的功能調控位點，把基因表達、表觀修飾等信息整合到預測模型，可顯著提高預測準確性。研究人員根據華西牛的43個經濟性狀表型和填充測序變異，構建了覆蓋基因組、轉錄組、代謝組和表觀組等層次的11個功能單核苷酸多態性分組，研發了整合多組學的基因組預測新方法。
研究表明，上述新方法與全基因組測序數據相比，高評分的前10%單核苷酸多態性組的預測準確率大幅提高，貝葉斯B方法模型下預測準確率平均提高11.6%，基因組最佳線性無偏預測方法平均提高7.54%。在與肉牛經濟效益顯著相關的日增重和宰前活重兩個性狀上，貝葉斯B方法預測準確率分別提高6.70%和5.73%。
該研究得到了國家重點研發計劃和國家自然科學基金等項目的資助。（通訊員 付松川）
原文鏈接：https://biologydirect.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13062-024-00574-y
