近日,中國農業科學院煙草研究所煙草種質資源與生物育種創新團隊為群體水平組學數據分析和可視化提供了“零代碼一站式”解決方案,極大地促進了作物育種中多維組學大數據的高效挖掘和利用。相關研究成果發表在《植物通訊(Plant Communications)》上。
為降低多組學數據關聯分析涉及的軟件安裝、數據清洗、質控、格式轉換、參數調整等技術門檻,該科研團隊開發了EasyOmics一站式分析軟件,將傳統需要數月學習的命令行操作轉化為直觀的圖形界面。軟件搭載八大核心模塊,包含數據質控、遺傳力評估到GWAS分析、組學數據關聯分析、孟德爾隨機化、數據展示等工具,完整覆蓋組學研究全流程。內嵌智能參數推薦系統,即使缺乏統計學背景的用戶,也能通過引導式操作完成復雜分析。研究者僅需點擊鼠標即可完成轉錄組與蛋白質組等數據的關聯分析,自動生成可直接投稿的矢量圖。該軟件支持Windows、macOS和Linux系統秒級部署。用戶無需配置復雜環境,通過預裝鏡像即可實現“下載即用”,較傳統方法節省大量的時間。
該研究得到國家自然科學基金等項目的支持。(通訊員 李曉娟)
原文鏈接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2590346225000550