4月22日,中國農業科學院鄭州果樹研究所桃資源與育種創新團隊發表了首個桃完整泛變異組圖譜,研究發現了70.6%的新變異和3289個新基因,揭示了全球桃的親緣關系和進化路線,開發了基因發掘新策略,實現了基因及功能變異的“一步定位”。相關研究發表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
該研究利用1020份桃種質基因組數據,檢測了結構變異等目前已知的所有變異類型,構建了首個完整變異組圖譜,包含70.6%的新變異;構建了泛基因組圖譜,鑒定了3289個新基因,發現桃馴化和進化過程中基因數目顯著增加;解析了全球桃基因漸滲關系,重構了全球桃傳播進化路線,發現扁桃參與了山桃的形成,栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃,甘肅桃參與了新疆桃的形成。研究還提出了基因定位新策略GWASPV,在40個農藝性狀、51個環境性狀和1857個代謝物性狀的基因定位中應用,新發現了2000多個關聯變異,實現了很多性狀關鍵基因和功能變異的一步鑒定,顯著提高了基因定位和基因發掘效率,為桃分子育種提供了理論依據和基因資源。
該研究得到了國家重點研發計劃、國家自然基金、中國農業科學院青創專項等項目的資助。(通訊員:趙倩)
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