近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所聯(lián)合有關(guān)單位開展野生和栽培苧麻基因組比較及群體進(jìn)化分析,首次系統(tǒng)揭示了苧麻馴化過程中基因組的演化特點(diǎn),并發(fā)現(xiàn)了多個(gè)纖維生長(zhǎng)相關(guān)基因的馴化選擇印跡,相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《植物雜志(The Plant Journal)》上。
苧麻是我國(guó)特有的纖維作物,在我國(guó)已有數(shù)千年的種植歷史。近年來在我國(guó)南方地區(qū)苧麻被用作優(yōu)質(zhì)飼草。但苧麻纖維含量高,會(huì)顯著影響飼草加工效率和動(dòng)物采食性能。因此,解析苧麻纖維形成機(jī)制,對(duì)于定向選育高纖維纖用苧麻或低纖維飼用苧麻均具有重要的意義。分類學(xué)、遺傳學(xué)等研究表明栽培苧麻是從野生苧麻( Boehmeria nivea var. tenacissima )馴化而來,但野生苧麻纖維產(chǎn)量并不高。可見,在栽培苧麻馴化過程中,纖維發(fā)育相關(guān)基因受到了重點(diǎn)選擇。然而,有關(guān)栽培苧麻的馴化分子機(jī)制,一直未被闡明。
研究人員測(cè)序組裝了野生種“青葉苧麻”和栽培種“中飼苧1號(hào)”基因組,得到兩個(gè)高質(zhì)量的基因組。通過序列比較發(fā)現(xiàn)兩個(gè)基因組存在大量序列變異。研究人員進(jìn)一步對(duì)14個(gè)野生苧麻種質(zhì)和46個(gè)栽培種進(jìn)行重測(cè)序,并構(gòu)建了苧麻的基因組變異圖譜。通過野生和栽培種苧麻基因組組裝和比較,結(jié)合群體變異組分析,科研人員發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與纖維產(chǎn)量相關(guān)的基因組片段具有清晰的馴化選擇印跡。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程和現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目資助。(通訊員 廖勇鳳)
原文鏈接:https://doi.org/10.1111/tpj.15346