近日,中國農業科學院生物技術研究所棉花生物技術設計育種創新團隊開發了一種用于驗證蛋白與DNA互作的SRS(SGR1-based reporter system)系統,該系統具有高效、可靠、智能化、可視化功能。相關研究成果發表在《植物生物技術雜志(Plant Biotechnology Journal)》上。
近年來,RNA-Seq、ChIP-Seq等組學技術推動了轉錄因子下游基因的規模化發現,但在植物體內快速且準確地驗證轉錄因子直接結合的下游靶基因依然具有挑戰性。
該研究通過使用葉綠素降解基因,開發了一個能夠通過觀察植物葉片顏色變化進行可視化報告的系統,并配套開發追蹤顏色變化的智能模型SMGY。目前,團隊開發的SRS系統已在水稻、棉花、辣椒等多種作物中成功驗證了5組不同類型的轉錄因子與DNA的互作,并證明該系統同樣適用于非煙草物種,如油菜和生菜等。SRS系統的開發為構建基因遺傳調控網絡及作物智能設計育種提供了一種新的技術方法。
該研究得到了科技創新2030重大項目、國家重點研發計劃、國家自然科學基金、中國農業科學院科技創新工程等項目資助。(通訊員:崔艷)
原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14488