作物科學所于2009年2月20～22日、25～28日，聘請國內(nèi)相關領域的著名專家組成4個考核委員會，分別對作物種質資源、作物遺傳育種、作物分子生物學、作物栽培生理四個系的各個課題組進行了五年綜合分類考核，內(nèi)容包括五年來科研方向與任務、研究工作進展、獲獎成果、發(fā)表論文（著作）和獲得專利等。翟虎渠院長、科技局領導，以及京區(qū)兄弟所等單位的領導和專家蒞臨會議并給予指導。
考核委員會在六天期間，分別聽取了30多個課題組的五年研究工作匯報，并進行了質疑討論，量化評價取得的成效。考核委員會認為作物科學所大部分課題組五年考核成效顯著。考核專家還對作物科學所的研究戰(zhàn)略布局、課題組研究方向、研究中存在的問題等，提出了非常中肯的意見和建議。
萬建民所長對此次考核進行了總結，他指出作物科學所要進一步凝練和調(diào)整研究方向，突出重點目標，加強課題組之間以及與全國相關院所的分工合作，加強條件平臺建設，繼續(xù)引進優(yōu)秀人才，促進作物科學又好又快發(fā)展。
目前，各課題組正在根據(jù)考核專家組的意見，制定整改方案。
