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    本報訊（通訊員李穎）中國農科院深圳農業基因組研究所副所長黃三文領導國際團隊，構建了番茄的變異組圖譜。該國際團隊通過對360份番茄種質全基因組的分析，發掘了1100多萬個SNP標記，重建了番茄馴化和育種的基因組學歷史，奠定了番茄全基因組設計育種的基礎。最新研究成果于10月13日在線發表于《自然·遺傳學》雜志。

    番茄是世界范圍內第一大蔬菜作物，在科研上也是植物遺傳、發育和生理研究的重要模式系統。黃三文介紹，食用的大果栽培番茄是由野生番茄馴化而來，果重是其祖先的100多倍。通過群體遺傳學分析，研究人員發現番茄經歷了從野生醋栗番茄形成櫻桃番茄，最終成為大果栽培番茄的兩步馴化過程。

    本研究運用了群體分化這一分析算法，發現了第五號染色體是決定鮮食番茄和加工番茄差異的主要基因組區域，此區域含有多個控制番茄可溶性固形物和果實硬度的基因，這些基因賦予了加工番茄顯著的特征。此外，通過全基因組關聯分析，研究人員此次還發現了決定粉果果皮顏色的關鍵變異位點，此位點的變異導致SlMYB12基因啟動子區域的缺失，進而影響該基因的表達，從而使得成熟的粉果番茄果皮中不能積累類黃酮。

    研究發現番茄的馴化和野生基因的導入共導致了約25%的基因組區域基本被固定，嚴重限制了番茄的進一步改良。番茄變異組圖譜的繪就，為打破馴化和導入帶來的連鎖累贅、進一步提高育種效率提供了知識基礎。