近日,中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所動物基因工程與種質創新科技創新團隊聯合北京相關生物企業等單位,成功繪制了梅山豬高質量基因組圖譜。該圖譜是迄今為止精度最高的亞洲豬基因組圖譜,為我國地方豬種質資源保護和開發利用奠定了基礎。相關成果發表于《分子生態資源》。
據項目負責人周榮博士介紹,我國地方豬種具有肉質好、抗逆性強、耐粗飼等特點,是生豬種業持續創新和實現種源自主可控的良好素材。國內外學者針對我國地方豬種的抗病力、繁殖性能等重要經濟性狀的遺傳機制開展了大量研究,產生了海量重測序、轉錄組數據,但分析研究這些數據需要與參考基因組進行比對,亞洲家豬的參考基因組圖譜卻一直沒有被測明。
產于我國的梅山豬。 中國農科院/供圖
本次,研究人員成功繪制了我國地方品種梅山豬的高質量基因組圖譜,共注釋到22074個編碼基因,是目前完整度最高、連續性最強的亞洲豬基因組圖譜。研究人員對梅山豬和西方主要的參考豬種——杜洛克豬的基因組進行了比較分析,發現梅山豬基因組共存在49103個結構變異,其中4.02%是亞洲豬特有的結構變異。研究還發現亞洲豬X染色體上存在一個特有結構變異熱點,該熱點富集了與亞洲豬脂肪沉積、高繁殖力等特異性表型相關的基因。