近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所草莓種質(zhì)改良團(tuán)隊(duì)聯(lián)合深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所共同發(fā)布八倍體草莓端粒到端粒基因組，系統(tǒng)解析了八倍體草莓亞基因組結(jié)構(gòu)和遺傳分化，并解析了亞基因組的表觀遺傳進(jìn)化機(jī)制。相關(guān)成果發(fā)表于《園藝研究（Horticulture Research）》。
記者了解到，該研究以紅顏草莓為材料，從頭組裝八倍體草莓端粒到端粒基因組，鑒定出包含ABCD四個亞基因組共109320個基因。通過構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，發(fā)現(xiàn)B、C和D亞基因組來源于同一祖先或祖先近緣種，C和D亞基因組最先被引入到八倍體基因組中，A亞基因組是最后的直接祖先供體。
分析表明，A亞基因組CG、CHG和CHH甲基化水平最低。亞基因組A偏向表達(dá)基因高于其他亞基因組，且A偏向表達(dá)同源基因多為基因體甲基化（gbM）。該研究為后續(xù)開展草莓基因功能挖掘、抗性分子育種和品質(zhì)改良提供了理論和數(shù)據(jù)支撐。
該研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程、河南省重大科技專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。
