茶樹是重要的經濟作物，傳統茶樹育種主要通過雜交和自然變異選育優良品種，育種周期長。如何更加精確、高效地育種一直是茶樹育種家關注的焦點。利用泛基因組輔助育種技術，有望實現更快速地植物性狀改良。
近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內多家單位成功構建出首個茶樹泛基因組圖譜，進一步揭示了茶樹基因組擴張的遺傳基礎，鑒定得到多個與茶葉顏色、香氣等農藝性狀相關的關鍵基因，為茶樹育種打下重要基礎。相關研究成果發表在《自然植物（Nature Plants）》上。
研究人員選取了大葉茶、小葉茶、白毛茶等22個代表茶樹遺傳多樣性和表型多樣性的茶樹品種進行測序組裝，得到了完整的茶樹泛基因組圖譜。
結合圖形泛基因組、群體基因組學以及代謝組數據的綜合分析，研究還鑒定到多個影響茶葉風味性狀的等位變異，包括兒茶素合成，茶香氣合成的核心基因的等位變異，該研究有助于理解茶樹的遺傳特性和表型多樣性，為茶樹分子育種改良提供了重要靶標。
該研究得到廣東省重點研發計劃、國家優秀青年科學基金等項目資助。
