本網(wǎng)訊 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜功能基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì),與國(guó)內(nèi)外同行合作發(fā)現(xiàn)了一個(gè)大片段DNA序列拷貝數(shù)變化可以決定黃瓜的性別,并揭示了該序列結(jié)構(gòu)變異產(chǎn)生的主要機(jī)制。研究成果對(duì)于進(jìn)一步揭示黃瓜性別決定機(jī)理具有重要的指導(dǎo)意義,并對(duì)培育高產(chǎn)黃瓜品種具有潛在的重要應(yīng)用價(jià)值。
黃瓜全雌系產(chǎn)生的性別決定機(jī)制一直是國(guó)內(nèi)外研究熱點(diǎn),多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)圍繞該問(wèn)題做了大量探索,但一直未得到明確答案。大片段DNA序列的結(jié)構(gòu)變異(Structural Variation,簡(jiǎn)稱SV)包括插入/缺失、拷貝數(shù)變化和倒位等多種類型,可引起許多人類疾病(如自閉癥和精神分裂癥)的發(fā)生,在植物中也有關(guān)于結(jié)構(gòu)變異引起農(nóng)藝性狀(如葉子大小和果實(shí)形狀)改變的少量報(bào)道,但是植物中結(jié)構(gòu)變異產(chǎn)生的機(jī)制及其對(duì)基因功能的影響鮮有報(bào)道。
該團(tuán)隊(duì)在2013年構(gòu)建了黃瓜全基因組變異圖譜的基礎(chǔ)上,利用這些數(shù)據(jù)深入開展了黃瓜SV的鑒定和分析工作,鑒定了近2.7萬(wàn)個(gè)SV位點(diǎn),涉及約1200萬(wàn)個(gè)堿基,影響近1700個(gè)基因的功能,并揭示了SV產(chǎn)生的主要機(jī)制。該研究發(fā)現(xiàn)黃瓜全雌系是由于一個(gè)30kb大小DNA片段的拷貝數(shù)增加引起,并且發(fā)現(xiàn)拷貝數(shù)增加應(yīng)該最初發(fā)生在東亞的一個(gè)黃瓜材料中,后來(lái)傳播到歐洲,形成產(chǎn)量較高的黃瓜品種。
相關(guān)成果發(fā)表于最新一期國(guó)際著名期刊《植物細(xì)胞(Plant Cell)》。