科技日報北京11月7日電 (記者瞿劍)據(jù)中國農(nóng)科院最新消息,該院蔬菜花卉所功能基因組學(xué)創(chuàng)新團隊通過基因組學(xué)、變異組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的綜合分析,并應(yīng)用稀有遺傳變異的分析策略,發(fā)現(xiàn)了控制黃瓜卷須發(fā)育的身份基因TEN,揭示了黃瓜卷須的同源器官是側(cè)枝——這一曾經(jīng)困擾達爾文的植物發(fā)育學(xué)謎團。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于最新一期國際知名學(xué)術(shù)刊物《分子植物》雜志。
論文第一作者、該院研究生院博士生王深浩介紹,卷須是黃瓜的攀援器官,但其“身份”即同源器官是什么并不清楚。在溫室中栽培的黃瓜并不需要卷須來攀援,為了減少生物量的浪費,農(nóng)民需要人工摘除卷須。培育完全沒有卷須的省力品種,是黃瓜育種的重要方向之一。而在農(nóng)業(yè)育種史上,稀有變異的利用具有重要意義,如水稻的不脫粒性和小麥矮稈等的稀有突變性狀等,被人類馴化和選擇成重要的農(nóng)藝性狀。
該團隊在世界范圍內(nèi)的3000多份黃瓜種質(zhì)里發(fā)現(xiàn)了唯一的一份無卷須的稀有黃瓜種質(zhì),其卷須被側(cè)枝所替代,失去攀援能力;表型觀察和遺傳分析表明,黃瓜的卷須和側(cè)枝是一對同源器官;經(jīng)進一步通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和稀有變異的綜合分析,在全基因組360多萬個變異中,發(fā)現(xiàn)了對應(yīng)無卷須種質(zhì)的一個稀有SNP。研究進一步發(fā)現(xiàn)該稀有變異顯著降低了TEN基因的轉(zhuǎn)錄激活功能,影響了一系列下游基因的表達,從而調(diào)控了卷須身份的轉(zhuǎn)換和卷須的運動。
本研究為在植物基因組中研究功能性稀有變異提供了一個范例,并揭示了黃瓜卷須同源器官為側(cè)枝這一歷史謎團,同時也為黃瓜無卷須株型育種提供了理論支撐。
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