分享到
[工人日報]世界首個野生梨基因組圖譜完成
豐富了梨屬植物基因組信息
發(fā)布時間:2019-08-22
|來源: 工人日報 2019年8月16日|作者:黃哲雯
記者獲悉,中國農科院果樹研究所研究員曹玉芬團隊與中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所研究員田志喜團隊,日前合作組裝了高質量的杜梨參考基因組序列——這是世界首個野生梨的基因組圖譜,也是我國在梨基因組學研究領域又一重大研究進展。
該基因組的公布豐富了梨屬植物基因組信息,同時將為梨基因組研究、功能基因挖掘、梨屬植物馴化以及野生資源利用提供重要保障。
據(jù)曹玉芬團隊介紹,科研人員以山西杜梨為材料,結合PacBio三代測序、Bionano光學圖譜、Hi-C技術,組裝了高質量的杜梨參考基因組序列。具體來看,杜梨基因組組裝大小為532.7兆,contig N50為1.57兆,共有59552個蛋白質編碼基因和247.4兆重復序列被注釋,通過BUSCO對基因組完整性進行評估,完整性達到95.9%。
研究認為,杜梨擴張基因在次生代謝通路中顯著富集,可能進而影響杜梨較強的逆境適應性。分析結果顯示,馴化過程中,東方梨的果實大小、糖代謝和轉運,以及光合效率受到正向選擇。
研究同時發(fā)現(xiàn),梨屬植物在馴化過程中果實酸澀味逐漸消失。杜梨原花青素合成結構基因拷貝數(shù)顯著多于白梨,影響了原花青素的積累,同時花青素還原酶代謝途徑是原花青素合成的唯一途徑,山梨醇轉運蛋白跨膜轉運可能是影響可溶性有機物質積累的主要因素。
打印本頁
關閉本頁
院網(wǎng)信息發(fā)布與管理
最新動態(tài)
- [工人日報]我國科學家破譯油菜害蟲西北斑芫菁染色體水平基因組2025-04-25
- [新京報]177.65公斤 新品種刷新我國三熟制模式下油菜單產紀錄2025-04-25
- 奶牛瘤胃微生物優(yōu)勢脲酶結構與綠色脲酶抑制劑2025-04-25
- 蛋白乙酰化修飾調控大口黑鱸肝臟炎癥和纖維化進程2025-04-25
- 陸地棉與海島棉葉片細胞類型的保守與分歧2025-04-25
- 能調控水稻粒重的新基因“鯤鵬”2025-04-25
- 楊振海走進樹人講堂 為研究生作專題講座2025-04-25
- 納米尺度“破譯”鎘與吸附材料間的相互作用2025-04-25
- 核酸標準物質新進展2025-04-25
- 抗病毒基因的敲除可提高植物病毒載體介導的蛋白表達2025-04-25