本報(bào)訊 (記者黃哲雯)中國(guó)農(nóng)科院棉花研究所牽頭主持,聯(lián)合北京大學(xué)、深圳華大基因、美國(guó)農(nóng)業(yè)部南方平原研究中心等單位,日前共同完成了世界上廣泛栽培的陸地棉的全基因組測(cè)序及圖譜繪制,在基因組學(xué)研究領(lǐng)域取得突破性成果。
異源四倍體物種陸地棉是世界上最重要的纖維作物和模式多倍體作物。棉屬包括46個(gè)二倍體和5個(gè)四倍體棉種,所有的二倍體棉種均來(lái)自同一祖先,經(jīng)演化形成了A、B、C、D、E、F、G和K基因組,四倍體棉種的基因組類型為AD。目前認(rèn)為,AD基因組是由A基因組祖先與D基因組祖先雜交后染色體加倍而形成的,其中就包括陸地棉。高質(zhì)量組裝異源多倍體植物基因組是一個(gè)艱難的任務(wù),因?yàn)檫@種基因組比較大,包含大量的重復(fù)序列和高度同源的亞基因組。
在該研究中,科研人員對(duì)陸地棉遺傳標(biāo)準(zhǔn)系—TM-1進(jìn)行了全基因組測(cè)序和組裝,最終獲得了26條染色體;通過(guò)基因組注釋,得到了76943個(gè)蛋白編碼基因;利用比較基因組學(xué)方法,首次從全基因組水平揭示了四倍體棉花是由A基因組的祖先和D基因組的祖先通過(guò)染色體融合而形成,并初步揭示了四倍體棉花基因組的進(jìn)化規(guī)律。
據(jù)該項(xiàng)目的主要負(fù)責(zé)人李付廣研究員介紹,我國(guó)是世界上最大的紡織品生產(chǎn)國(guó)和消費(fèi)國(guó),在國(guó)民經(jīng)濟(jì)中具有十分重要的地位。四倍體棉花-陸地棉(AD組)基因組圖譜繪制完成,將加快棉花新品種的選育,對(duì)我國(guó)棉花產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。