近日,中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊聯合國內其他科研單位,構建了國際首個雙生病毒—植物—昆蟲數據庫。該數據庫提供了最完整的雙生病毒、寄主植物、傳毒介體,病毒—植物—昆蟲互作信息,并提供多種在線工具,可實現相關文獻同步更新。相關研究成果在線發表于《分子植物》(Molecular Plant)。
國際首次建立雙生病毒—植物—昆蟲數據庫。中國農科院供圖
雙生病毒是全球范圍內危害植物最嚴重的病原物之一,有520多種,可通過煙粉虱、葉蟬和蚜蟲等傳播,侵染棉花、番茄及瓜果等多種重要經濟作物,造成嚴重的經濟損失。
據悉,該數據庫主要包括雙生病毒相關信息的瀏覽、可視化、進化分析、工具欄、文獻五大模塊,可完成病毒、寄主信息的完整搜索與下載,為雙生病毒的后續研究奠定了重要基礎。
數據庫利用網絡結構將病毒—植物—昆蟲的互作關系進行可視化,通過雙生病毒全基因組序列比對,構建了目前最為全面的雙生病毒科的系統發育關系。同時,該數據庫提供比對功能,可對病毒基因、蛋白進行比對與搜索,并及時更新雙生病毒相關的研究進展及重要國際雙生病毒研究人員。
該研究得到國家自然科學基金及國家重點研發計劃等項目的資助。
相關論文信息:https://doi.org/10.1016/j.molp.2023.02.007