本報訊 近日,記者從中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所獲悉,該所畜禽資源收集、保護與創新利用團隊利用馬高密度基因芯片對德保矮馬矮小特性進行研究,發現了影響德保矮馬矮小特性相關關鍵基因TBX3,首次從全基因組水平上揭示德保矮馬矮小特性存在不同于國外矮馬的獨立矮化機制。該成果已在線發表于國際學術期刊《基因組生物學和進化(Genome biology and evolution )》。
體尺大小是進化過程中物種間及物種內差異較大的數量性狀。了解體尺大小相關的遺傳基礎對研究人類疾病相關的遺傳機制以及家養動物人工選擇和提高生產性能的重大課題之一。
該團隊長期致力于動物遺傳資源評價和特色基因資源挖掘研究,并探索遺傳資源的保護和可持續利用。此次通過利用馬高密度基因芯片(GeneSeek Equine SNP 65K)對中國體高差異較大的三個品種(德保矮馬、蒙古馬、伊犁馬)和國外32個馬匹品種構建了系統進化樹并檢測選擇信號。國內外馬品種構建的系統進化樹顯示,德保矮馬可能存在與國外矮馬不同的獨立馴化歷史事件。選擇信號及全基因組關聯分析發現,在德保矮馬基因組上檢測到了523個顯著選擇信號位點。包含TBX3基因的基因組區域的三個SNP位點與德保矮馬體高相關性最高。結果表明,TBX3 基因是在決定德保矮馬體尺差異中發揮了重要作用的關鍵基因。
該研究為德保矮馬起源及矮小特性的遺傳基礎提供了分子理論依據,同時也為標記輔助選擇在德保矮馬育種中的應用奠定了基礎。
該研究由中國農業科學院科技創新工程和家養動物種質資源共享平臺資助。
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