近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)生物轉(zhuǎn)錄組與代謝組創(chuàng)新團隊發(fā)表首個人參端粒到端粒完整基因組,解析了重要活性成分三萜皂苷多樣化的形成機制,相關(guān)研究成果發(fā)表于《園藝研究(Horticulture research)》。
人參被譽為“百草之王”,具有重要藥用價值。三萜皂苷是其主要活性成分之一,對中樞系統(tǒng)和心腦血管具有顯著保護作用。
圖注:人參端粒到端粒基因組
人參是異源四倍體,遺傳背景復(fù)雜。研究人員結(jié)合多種測序技術(shù)構(gòu)建了人參完整基因組,基因組大小為3.45Gb,完整性評估為99.3%,鑒定到了48個端粒,預(yù)測了24個著絲粒,大幅提升人參基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性。
在此基礎(chǔ)上,研究進一步探究了異源四倍體形成過程中人參皂苷合成基因的不平衡進化,發(fā)現(xiàn)串聯(lián)重復(fù)和近端重復(fù)在人參皂苷的生物合成中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,并證明了亞基因組優(yōu)勢現(xiàn)象在人參中的存在。該研究為人參優(yōu)異種質(zhì)選育和生物合成人參三萜皂苷奠定了理論基礎(chǔ)。
該研究獲得國家重點研發(fā)計劃、吉林省科技發(fā)展計劃等項目的資助。