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[中國科學報]棉花基因組學研究獲重大進展
二倍體棉花—雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成
發布時間:2012-09-10
|來源: 《中國科學報》2012年9月8日|作者:黃明明
本報安陽9月7日訊(記者黃明明)記者今天從河南省安陽市召開的“二倍體棉花—雷蒙德氏棉全基因組圖繪制完成”新聞發布會上獲悉,在中國農業科學院棉花研究所的主持下,深圳華大基因研究院、北京大學、美國農業部南方平原研究中心、哥本哈根大學、荷蘭瓦赫寧根大學等單位共同合作完成了二倍體棉花—雷蒙德氏棉的全基因組草圖。日前,研究成果以《二倍體棉花—雷蒙德氏棉的基因組草圖》為題在線發表于國際學術期刊《自然—遺傳學》。
業內專家表示,該成果將對棉花基礎研究和應用研究發揮巨大的推動作用,為我國棉花重要功能基因挖掘與利用、分子育種,乃至全基因組設計育種提供前所未有的機遇。
據了解,棉花除作為全球重要的經濟作物之外,還是一種研究多倍體化、細胞伸長和細胞壁生物合成極好的模式系統。雷蒙德氏棉是現在陸地棉祖先的兩個供體種之一,該棉花基因草圖的完成,為進一步解析陸地棉全基因組序列奠定了堅實的基礎。
研究團隊采用全基因組鳥槍法結合新一代的高通量DNA測序技術,對雷蒙德氏棉進行了全基因組測序,獲得了其87.7%的全基因組序列。研究結果證明,棉花基因組經歷了真雙子葉植物共同經歷的一次古六倍化事件和一次棉屬特異的全基因組復制事件,表明了其古多倍體起源。
此外,研究人員推測雷蒙德氏棉基因組約包含40976個蛋白質編碼基因,并從基因組注釋結果中發現了2706個轉錄因子,其中大量的MYB和bHLH基因在花后0天和3天的胚珠中表達。該結果暗示這些基因可能為早期纖維發育所必需。
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