近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)研究獲得接近完整組裝的白菜基因組，揭示白菜著絲粒的快速進(jìn)化特征。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于《植物生物技術(shù)》（Plant Biotechnology Journal）。
大白菜 中國農(nóng)科院供圖
白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一，是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個(gè)完成基因組測序的物種，白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。但是，目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個(gè)缺口，其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。
該團(tuán)隊(duì)利用三代測序技術(shù)，獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補(bǔ)了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口，完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝，僅有2條染色體仍存在一個(gè)缺口。該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，著絲粒區(qū)域長末端重復(fù)序列的平均插入時(shí)間為14萬年，顯著晚于泛著絲粒區(qū)域，表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進(jìn)化。
該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目等項(xiàng)目的支持。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1111/pbi.14015
