近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所開發了新的重測序文庫制備方法——“AIO-seq”。該方法簡化了文庫制備的流程，極大地降低了文庫制備的成本，為高通量全基因組重測序在育種中應用掃除了高成本障礙。相關研究成果在線發表在《植物-方法（Plant Methods）》上。
據常玉曉研究員介紹，全基因組基因型鑒定在育種中具有重要的作用。雖然目前基于二代測序的全基因組基因型鑒定在技術層面已經非常成熟，但是其高昂的價格限制了在育種中的廣泛應用。育種家普遍期望單個樣本的全基因組基因型鑒定的價格能夠降低至10美元左右。
圍繞這一技術難題，該課題組優化了常規的重測序文庫制備方法，將傳統方法文庫擴增后的文庫分選和定量這2個步驟，從“每個樣品單獨操作”的繁瑣流程，優化為“多個樣品混合操作”的簡化流程。通過簡化，可以實現一百多份樣品混在一起只進行一次文庫的分選和定量，大大降低了重測序文庫的建庫時間成本和試劑成本。此外，該方法還結合質量越來越好的國產建庫試劑，進一步降低了試劑成本。最終應用新方法AIO-seq，可以將全基因組基因型鑒定的成本降低到育種家期望的10美元，為NGS在育種中的廣泛應用掃除了障礙。
文章審稿人高度評價該研究成果，表示AIO-seq方法可以加快科研項目進度，將成為重測序的標準方法，在育種研究特別是植物育種中，有重要的應用價值。
該研究得到中央級公益性科研院所基本科研業務費、中國農科院科技創新工程、深圳市科創委基金，以及廣西自然科學基金資助。（通訊員 趙華）
原文鏈接：https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-020-00615-3
