中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所王曉武科研團隊和美國科學院院士邁克•菲林(Michael Freeling)科研團隊合作,對植物基因組多倍化進化進行了深入研究,發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)座子甲基化調(diào)控基因分化和多基因組分化的表觀遺傳機制,將對基因組進化和植物遺傳育種產(chǎn)生重要影響。相關(guān)研究結(jié)果于3月24日在線發(fā)表于國際權(quán)威學術(shù)雜志《美國科學院院刊》(PNAS)上。
植物在進化過程中通過基因組加倍(多倍化)的擴增方式進行自我進化和適應自然環(huán)境。隨著DNA測序技術(shù)的快速發(fā)展,越來越多的植物基因組被公布,通過比較基因組學來闡明植物多倍化進化機制成為可能。該研究以之前完成的白菜基因組序列為基礎(chǔ),發(fā)現(xiàn)白菜基因組可以被劃分為3個亞基因組,而且存在一個基因數(shù)量顯著超過其它亞基因組的優(yōu)勢亞基因組,并且該基因組同時在基因表達上也具有優(yōu)勢。經(jīng)過深入研究,同時發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子(轉(zhuǎn)座子是廣泛存在于植物基因組上的一類重復序列元件)在亞基因組水平對基因表達具有重要影響,是3個亞基因組基因表達分化的重要因素;小RNA(smRNA)通過沉默轉(zhuǎn)座子從而沉默附近基因的方式,促進了優(yōu)勢亞基因組的形成,從而造成了基因組層面的分化。兩種分化機制的闡明,將為解釋雜交優(yōu)勢現(xiàn)象和C值悖論(物種結(jié)構(gòu)復雜程度與基因組大小無關(guān))提供指導。
據(jù)悉,王曉武團隊長期從事白菜等蕓薹屬植物基因組的研究,該成果是繼2013年明確蕓薹屬及其近緣物種的共同祖先基因組后,在植物進化方面又一突破性進展,也是中國農(nóng)科院國際合作的又一成功實例。該研究得到了科技部973、863,國家自然科學基金等項目的資助。(通訊員 李海芬)
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