近日，中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)宏基因組學創(chuàng)新團隊構(gòu)建了六倍體菊芋染色體級別參考基因組，解析了菊芋基因組起源和演化過程，為向日葵屬作物的起源進化研究、抗逆基因挖掘、育種改良和工業(yè)化利用提供了寶貴的資源。相關(guān)研究成果發(fā)表在《植物通訊（Plant Communications）》上。
菊芋俗稱洋姜，兼具生態(tài)防護和經(jīng)濟利用雙重價值，然而菊芋基因組極其復雜，基因組的測序組裝面臨重復序列比例高、雜合度高、染色體數(shù)多等挑戰(zhàn)，其六倍體基因組至今仍未破譯。
研究人員利用測序等技術(shù)，完成了六倍體菊芋的高質(zhì)量染色體級別組裝，基因組組裝大小為10.5 Gb，共含有199842個蛋白編碼基因。研究首次發(fā)現(xiàn)，菊芋約2百萬年前發(fā)生了全基因組三倍化事件，是菊芋形成六倍體的主要原因。
該研究得到國家重點研發(fā)計劃、深圳市基礎(chǔ)研究項目、深圳市重點實驗室基金和農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新計劃的支持。（通訊員 馬昕怡）
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https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100767
