2009年8月26日，在科技部等六部委的指導下，由杭州能源環境工程有限公司、北京德青源等13家科技公司和清華大學、中科院等6家高校科研院所共同組成的生物燃氣產業技術創新戰略聯盟在北京成立。我所陳巧敏副所長作為聯盟理事單位代表出席了成立大會，農業資源開發與設施農業工程技術中心主任陳永生高工應聘擔任聯盟專家委員會委員。
聯盟成立后，南京農機化所將主要圍繞生物燃氣工程發酵原料預處理、發酵產物（沼液、沼渣）利用及其他方面的配套裝備技術，和其他聯盟成員單位一起開展合作研發，為推動我國生物燃氣設備技術升級和產業化作出貢獻。
生物燃氣產業技術創新戰略聯盟將通過產學研合作，突破我國生物燃氣的關鍵技術，實現我國生物燃氣產業化。聯盟在近3至5年內，將為5個城市1000輛汽車提供清潔生物燃氣；建成50座兆瓦級熱、電、肥聯產生物燃氣電廠；為500個新農村提供生物燃氣集中供氣；建立100萬畝以沼氣為紐帶的可持續發展生態農業示范區。
