近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所種質(zhì)資源團隊在黃麻基因組織特異表達研究方面取得重要進展,通過比較轉(zhuǎn)錄組和基因網(wǎng)路共表達分析,充分挖掘在營養(yǎng)生長期和生殖生長期,黃麻根、莖皮、葉、花和果實中特異表達的基因和顯著相關(guān)的表達模塊,成功構(gòu)建了黃麻基因組織表達數(shù)據(jù)庫,為黃麻功能基因挖掘奠定基礎(chǔ)。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《BMC基因組學(xué)(BMC Genomics)》和《工業(yè)作物和產(chǎn)品(Industrial Crops & Products)》上。
據(jù)楊澤茂副研究員介紹,黃麻是世界上種植面積和產(chǎn)量最大的韌皮纖維作物。近年來,黃麻除了用作纖維,在藥用、食用、環(huán)保型材料等多用途利用方面的研究也不斷深入。黃麻基因組織表達數(shù)據(jù)庫的建立為改良黃麻各組織經(jīng)濟價值提供了基因數(shù)據(jù)資源?;邳S麻基因組織表達數(shù)據(jù)庫,研究人員在莖皮中成功挖掘到一個控制纖維發(fā)育的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)由22個基因組成,其中一個轉(zhuǎn)錄因子起到核心調(diào)控作用。在花器官中,發(fā)現(xiàn)黃酮類合成代謝通路高度富集,多數(shù)基因表達上調(diào)。
該研究得到中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程、國家自然科學(xué)基金及湖南省自然科學(xué)基金等項目資助。(通訊員 廖勇鳳)
原文鏈接:
?。?)https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2020.112101
?。?)https://doi.org/10.1186/s12864-020-06805-6
黃麻基因共表達網(wǎng)絡(luò)
莖皮中轉(zhuǎn)錄因子OMO55970.1調(diào)控的纖維發(fā)育相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)
黃麻花器官中黃酮類合成代謝通路和基因表達