近日,從中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所獲悉,該所豬遺傳育種科技創新團隊通過對豬全基因拷貝數變異進行掃描,獲得了多個與豬肉品質性狀顯著相關的基因拷貝數變異。相關研究成果于2015年8月正式發表于國際學術期刊《科學報告(Scientific Reports)上。
我國地方豬種以肉質好而聞名于世,如何將我國地方豬種高肌內脂肪含量(IMF)等遺傳優勢盡快轉入到占絕大部分市場的瘦肉型豬中去又不使其它性狀受到過多影響,是目前研究者們面臨的一項重大課題。研究表明,作為基因組覆蓋范圍最廣的變異之一,拷貝數變異(CNVs)對多種性狀都發揮了重要功能,是解釋單核酸多態性(SNP)效應之外“丟失的遺傳”的最可能變異之一。
該團隊在對高肌內脂肪含量、大理石紋、屠宰后6小時、24小時的pH值、水分及剪切力的關聯研究中共得到長度從208.53Kb到3.27Mb等長度不等的15個拷貝數變異。驗證試驗發現,15個拷貝數變異全部能被二代測序結果驗證,73.3%(11/15)能被定量表達結果驗證。關聯分析結果顯示,與肉質性狀相關聯的拷貝數變異共有8個。在進行關聯分析的12個性狀中,有4個性狀與1個以上拷貝數變異有顯著關聯。綜合神經生長因子1(Ntn1)基因內的拷貝數變異劑量、基因表達等結果,推測Ntn1基因通過內部拷貝數變異的劑量效應對高肌內脂肪含量產生一定影響,可作為肉質性狀的候選標記之一進行育種。
據悉,在豬全基因組范圍內進行肉質性狀關聯的研究在國際上尚屬首次。
發表論文鏈接:http://www.nature.com/articles/srep12535
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