隨著高通量測序技術的不斷發展，上萬種生物的全基因組DNA序列被測序完成。其基因組的注釋主要基于預測軟件和已知蛋白的同源搜索，不可避免地導致編碼蛋白質基因的錯誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外，由于缺少肽段等信息，大量基因被注釋為未知功能或假設的蛋白質。蛋白質基因組（Proteogenomics）是一種利用蛋白質組學的相關數據對基因組進行注釋校正的新方法，由于其結合了大量生物體蛋白質氨基酸信息，從而有力地彌補基因組上基因尋找和注釋的不足。小菜蛾是一種世界性重要農業害蟲，每年因小菜蛾造成的損失高達40億–50億美元。小菜蛾幾乎對所有的殺蟲劑均產生了不同程度的抗藥性，包括微生物殺蟲劑Bt。該團隊利用鳥槍法高效液相色譜-電噴霧-質譜/質譜（shotgun HPLC-ESI-MS/MS）對小菜蛾幼蟲中腸蛋白質進行測定，結合其基因組數據，完成了首個小菜蛾中腸蛋白質基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質譜圖，鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲劑抗性相關的蛋白質，同時，還糾正了小菜蛾的基因注釋，鑒定了大量新基因以及新的基因剪切形式。
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