近日,從中國農業科學院油料作物研究所獲悉,由我國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目再次取得階段性重大成果,項目組完成了甘藍基因組測序和分析,并在此基礎上與其它近緣種植物基因組比較,發現了作物種間和種內基因組呈現多層次的不對稱的進化規律。該研究于5月23日在線發表在國際權威學術期刊《Nature Communications》上。
據悉,我國主要油料作物油菜(基因組命名為AACC)、主要蔬菜作物白菜(基因組為AA)和甘藍(基因組為CC)同屬于蕓薹屬作物,而油菜是由白菜和甘藍雜交后進化而來的。甘藍和白菜共同祖先種的基因組含三份同源基因組(三倍化,稱為亞基因組)。甘藍基因組測序是白菜、甘藍和油菜等蕓薹屬全基因組測序項目的一部分。
據甘藍項目組技術負責人、油料所劉勝毅研究員介紹,甘藍基因組至少包含45758個蛋白編碼基因,與白菜基因組相似,其基因組的大部分能夠與十字花科近緣模式植物擬南芥基因組建立共線性關系,進而為基因組進化研究提供了良好的模式材料。通過對這組模式材料的分析,科學家最終揭示出甘藍和白菜基因組間存在轉座子擴增的不對稱性、串聯重復基因擴增的不對稱性、可變剪切數量的不對稱性及共線性區外基因丟失率的不對稱性,而在種內的亞基因組間存在基因丟失率差異以及亞基因組間同源基因的序列分化、表達分化、可變剪切分化等不對稱性進化。這個規律的揭示對雜交育種具有重要的直接指導意義。
該項研究的另一個重要發現是,甘藍基因組擁有合成更多更廣抗癌類物質的基因基礎。此前的研究已表明食用十字花科作物新鮮組織具有明顯的抗癌效果,而甘藍可能最有效。
油菜和甘藍基因組測序和分析項目總負責人、油料所王漢中研究員介紹,蕓薹屬作物基因組學研究是一項基礎性工作,其研究成果對有效指導和促進油菜等蕓薹屬作物的遺傳改良具有重要意義,比如,能使今后的蕓薹屬作物基因轉移變得有的放矢,使油菜的分子育種成為可能,尤其是克服油菜遺傳基礎狹窄等問題。
該項成果是在中國農科院油料所和蔬菜所、深圳華大基因研究院主導下,聯合華中農業大學、湖南大學、西南大學、江蘇農科院、四川農科院、青海農科院等多所國內研究機構以及美、澳、加、英、法、韓等國的相關研究機構科研人員共同完成,這是繼白菜基因組測序項目后的又一重大成果。(通訊員 余波)