近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所水稻優(yōu)異種質(zhì)資源創(chuàng)新利用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首次組裝了普通野生稻單倍型無間隙染色體基因組，構(gòu)建了野生稻種質(zhì)資源優(yōu)異基因發(fā)掘利用與種質(zhì)創(chuàng)新的平臺(tái)，并鑒定了關(guān)鍵的耐鹽與抗稻瘟病基因。相關(guān)研究成果發(fā)表在《自然通訊（Nature Communications）》上。
栽培稻是由二倍體普通野生稻馴化而來，在其馴化過程中野生稻所攜帶的大量優(yōu)異性狀等位基因丟失或者被削弱。但野生稻雜合度高導(dǎo)致基因組組裝困難，且大量的優(yōu)異抗性基因與不利性狀連鎖，導(dǎo)致育種中難以直接利用。
該研究團(tuán)隊(duì)以綜合抗性優(yōu)良的中國普通野生稻“Y476”為載體，首次組裝了單倍型無間隙染色體基因組，并以此為基礎(chǔ)，分別以秈稻“9311”和粳稻“日本晴”為受體親本，構(gòu)建了兩套覆蓋全基因組的染色體片段置換系，建立一個(gè)能夠高通量鑒定發(fā)掘野生稻優(yōu)異基因的平臺(tái)。同時(shí)利用該平臺(tái)鑒定出一個(gè)耐鹽相關(guān)基因與一個(gè)抗稻瘟病基因。該研究為野生稻基因挖掘提供了高效平臺(tái)，為稻種資源利用與品種遺傳改良提供了先進(jìn)工具。
該研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的支持。（通訊員 田浩園）
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-48845-6
