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　　自2004年初開始，草原研究所根據科技部、財政部、中編委聯合下發的“關于農業部等九個部門所屬科研機構改革方案的批復”，進行了大量的調研，并結合研究所實際制定了《科技體制改革總體方案》和與之相配套的8個附屬文件，經過認真、反復討論、修改與完善，已全面實施。到目前，通過機構改革和調整，形成了科技創新、產業發展和后勤服務三大體系。總的看來，總體構架合理、發展目標明確，初步實現了分類管理。
一、精簡機構、明確職責
　　將原綜合管理處、科技管理處、科技開發處和財務與資產處四個職能部門調整為辦公室、人事處（黨辦）和科技管理處，并在全所范圍內對職能管理部門和后勤服務中心處級領導崗位進行了公開招聘。
　　通過調整，職能管理部門人員由原來的39人精簡到15人，其中，具有博士學位1人，具有碩士學位3人，具有本科以上學歷9人，具有大專以上學歷2人；平均年齡為43歲。職能部門人員的整體素質和工作積極性有了明顯的提高。
二、學科調整
　　經過資源的重新整合，完成了學科建設的整體構架，為草原所學科建設搭建了有利于發展的平臺。
　　草原所的重點研究方向與內容確定為，草地資源動態監測及數字化管理，草原火災、雪災等自然災害的監測與預警；國內外草類種質資源的考察、收集、鑒定、評價、篩選利用、保存研究和數據基礎共享平臺建設，優良牧草新品種的培育；開展不同類型草地退化機理及恢復技術研究、草地畜牧業持續高效生產配套技術研究；開展牧草收獲、加工、貯藏、草地保護性耕作機械研制與配套工藝研究和草地有害生物種群發生規律及綜合防治技術等研究。
　　新設置的學科，方向更加明確，人才配置更為合理，優勢更加突出，既兼顧了傳統優勢學科的研究方向，又增添了新的研究內容，在兼顧基礎研究的同時，又加強了實用技術和高新技術的研究。
三、人事制度改革
　　通過各崗位的公開招聘，雙向選擇，打破了工作崗位終身制，在全所范圍內的各個工作崗位首次實行了全員聘任。
　　通過人事制度改革，共聘用中國農科院三級杰出人才5人；研究所科研一級崗位10人，科研二級崗位1人，科研三級崗位16人，科研四級崗位5人，科研輔助崗位4人；管理崗位15人；共向所內公益性崗位分流13人；向產業發展崗位分流16人；向后勤服務崗位分流人員34人。
四、內部分配制度改革
　　建立了“基本工資、崗位工資、績效工資”相結合的分配制度。根據工作性質和要求，確定了各個工作崗位的績效工資系數，各崗位按照相應的工資系數執行相應的工資標準。
　　管理崗位工資系數：正所級領導35、副所級領導30；正處級崗位25、副處級崗位23；職能管理崗位15。
　　科研崗位工資系數：科研一級35、科研二級30、科研三級20、科研四級15；科研輔助10。
　　除上述崗位外，將公益性（科技支撐）、科技開發、后勤服務的具體工作崗位分為一級和二級，崗位工資標準分別為15、11。
　　通過收入分配制度的改革，使全所職工的收入水平得到較大提高，上崗人員月增資平均1800元，其中，在科研崗位工作的科研人員月增資平均2300元。
五、產業發展
　　改革前，草原所原來注冊的公司已基本處于停頓狀態，通過改革，公司的各項工作已全部啟動，并在原來的基礎上擴大了公司的規模。在經營上，進一步明確了公司各項經營工作的范圍、內容和具體工作任務及總體目標。將現有的試驗場、站全部由公司按照企業的管理方式進行管理。
　　另外，對公司各類崗位提出相應標準與要求，并進行公開招聘，相關人員根據自己的條件和優勢等進行競聘。研究所對所有參與競聘的人員，包括公司總經理和公司員工，均采取逐級競聘制，同時與競聘上崗的人員簽定了聘任合同。
六、工作中遇到的困難
　　草原所的建所時間較長，地處少數民族地區，離退休職工數量較多，他們的工資收入水平低，與呼和浩特地區同類單位相比，收入差距很大。希望上級部門能夠考慮草原所實際問題，增加經費投入。